الوزارة تشرف تقنياً على المؤسسات التالية : المكتب الوطني للسكك الحديدية, المكتب الوطني للمطارات, الوكالة المغربية لتنمية الأنشطة اللوجيستيكية, الشركة الوطنية للنقل واللوجستيك, الوكالة الوطنية للسلامة الطرقية.